Produktionen af fiskemel afsluttes generelt gennem flere nøgleprocesser, herunder tilberedning, presning, tørring, formaling og opbevaring. Mens det grundlæggende forarbejdningsprincip er relativt ligetil, kan variationer i råvarens friskhed, forarbejdningsteknologi, udstyr og driftserfaring resultere i betydelige forskelle i den endelige produktkvalitet.
1. Efter tilberedning koagulerer fiskeproteinet, hvilket tillader en stor mængde vand og olie at blive frigivet.
2. Den kogte fisk føres derefter ind i et perforeret pressekammer, hvor den komprimeres mekanisk. Den flydende blanding af olie og vand (fiskelud) ekstraheres, mens den faste pressekage udtømmes fra udløbet. Den ekstraherede fiskelud separeres yderligere i fiskeolie og stikvand gennem en olie-vandseparationsproces.
3. Klæbevandet recirkuleres tilbage i systemet og blandes med pressekagen, inden det går ind i tørrefasen for at producere helt fiskemel. Der er to hovedtørringsmetoder: direkte tørring og indirekte tørring. Direkte tørring kan påvirke produktkvaliteten betydeligt, så moderne systemer anvender i stigende grad dampbaseret-indirekte tørring eller lav-vakuumtørring for at sikre bedre kvalitet.
4. Til sidst males større fiskeben fint til pulver og blandes med fiskemelet inden emballering og opbevaring.
